Michael Kenmore se infiltrează în Atlantida cu o armată a hibrizilor săi și blochează operațiunile Porții Stelare și nivelurile înconjurătoare, pentru a împiedica pe oricine să preia controlul. Planul lui: să-i captureze pe Teyla Emmagan și pe copilul acesteia pentru a-și perfecționa Hibrizii și de a distruge baza atunci când au terminat. Între timp, Colonelul John Sheppard, Dr. Rodney McKay și o echipă, încearcă să preia controlul orașului înainte ca Michael să plece cu ceea ce își dorește.