Acht uren zijn er verstreken sinds de ontsnapping. Michael, Lincoln, Sucre, C-Note en Abruzzi proberen hun zoekers voor te blijven. Bellick wordt gedwongen om de leiding bij de zoektocht af te staan aan FBI Special Agent Alexander Mahone, wiens ingenieuze aanpak het Michael erg lastig maakt. Als gevolg van haar overdosis is Dr. Tancredi in kritieke toestand. Een onthande T-Bag wordt geconfronteerd met de ultieme uitdaging.